재난 현장에 출동해 단 한 명의 사망자도 내지 않는 이동하는 응급의료팀 도쿄 MER. 이번엔 요코하마 랜드마크 타워 폭발현장에 파견되어 구조를 시작하는데 위험한 현장에 직접 뛰어드는 도쿄 MER과 경쟁하는 요코하마 MER 사이에 갈등이 생겨난다. 그 사이 거세지는 화마가 지상 70층에 갇힌 193명을 위협하고 구조 헬기마저 접근할 수 없게 되면서 도쿄 MER과 요코하마 MER의 물러설 수 없는 구조작전이 시작되는데…